Hàng năm Viện hàn lâm Khoa học Úc trao các huy chương sau đây:

• Huy chương Pawsey, cho một nhà Vật lý học trẻ;
• Huy chương Gottschalk, cho một nhà nghiên cứu Y học trẻ;
• Huy chương Frank Fenner cho một nhà Sinh học trẻ.
• Huy chương Ian William Wark & Lecture và Lloyd Rees Lecture, cho các nhà khoa học tạo sự liên kết giữa khoa học và công nghiệp;
• Huy chương Thomas Ranken Lyle, cho các nhà nghiên cứu Toán học và Vật lý học;
• Huy chương David P. Craig, cho các nhà nghiên cứu Hóa học;
• Huy chương Douglas Mawson & Lecture, Huy chương John Conrad Jaeger, Huy chương Haddon King, và Giải Dorothy Hill, cho các nhà nghiên cứu Khoa học Trái Đất;
• Huy chương Moran và Huy chương Hannan, cho Toán học.